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深圳科研人員發(fā)現(xiàn)人類(lèi)HLA新等位基因33個(gè)

更新時(shí)間:2010-10-25 11:02:39 來(lái)源:|0 瀏覽0收藏0

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  日前,從深圳市血液中心獲悉,設(shè)立于該中心的深圳市組織配型與免疫遺傳醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室近日傳出喜訊:由實(shí)驗(yàn)室鄧志輝、徐筠娉等13位科研人員組成的科研團(tuán)隊(duì),歷經(jīng)4年的艱苦研究,率先在國(guó)際上大量、系統(tǒng)地發(fā)現(xiàn)和鑒定了中國(guó)漢族人群中的33個(gè)HLA新等位基因,測(cè)定了110個(gè)HLA等位基因全長(zhǎng)序列。這33個(gè)HLA新等位基因和所測(cè)定的110個(gè)HLA等位基因全長(zhǎng)序列,均已得到世界衛(wèi)生組織(WHO)HLA因子命名委員會(huì)的認(rèn)可。

  2010年9月12日,由中國(guó)科學(xué)院院士姚開(kāi)泰教授,以及來(lái)自北京、上海、廣州、深圳的腫瘤學(xué)、免疫遺傳學(xué)、骨髓和實(shí)體器官移植、臨床組織配型等專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域的國(guó)內(nèi)知名老師組成的科技成果鑒定委員會(huì),對(duì)市血液中心完成的科研成果“HLA全長(zhǎng)序列測(cè)定及測(cè)序分型試劑的研制和應(yīng)用”進(jìn)行了全面、細(xì)致的審定,一致認(rèn)為:該成果的創(chuàng)新性強(qiáng),整體達(dá)到國(guó)際先進(jìn),部分達(dá)到國(guó)際領(lǐng)先水平。

  測(cè)定HLA全長(zhǎng)序列意義重大

  人類(lèi)白細(xì)胞抗原(HLA)是人類(lèi)最重要的免疫遺傳基因和器官移植免疫基因,與臨床骨髓和實(shí)體器官移植后排斥反應(yīng)及移植物長(zhǎng)期生存、白血病的復(fù)發(fā)率密切相關(guān);HLA還與艾滋病(HIV)病毒感染、腫瘤、免疫關(guān)聯(lián)疾病的易感、發(fā)生發(fā)展和預(yù)后密切關(guān)聯(lián);在法醫(yī)DNA物證鑒定、人類(lèi)進(jìn)化等領(lǐng)域,HLA均被廣泛應(yīng)用。

  據(jù)了解,自1958年第一個(gè)HLA抗原被發(fā)現(xiàn)至今年7月,世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會(huì)命名的HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因已達(dá)到4836個(gè)。進(jìn)行無(wú)關(guān)供、受者造血干細(xì)胞(骨髓)移植時(shí),要求供、受者雙方的HLA基因型盡可能相合。

  當(dāng)前,盡管?chē)?guó)際上發(fā)現(xiàn)的HLA新等位基因數(shù)量的增加十分迅速,但所公布的HLA等位基因全長(zhǎng)序列卻微乎其微,特別是缺乏中國(guó)人群HLA等位基因全長(zhǎng)序列。另一方面,在臨床骨髓和器官移植組織配型工作中,“國(guó)內(nèi)使用的HLA測(cè)序分型試劑尚依賴(lài)于國(guó)外進(jìn)口的商品化試劑盒,價(jià)格較為昂貴,限制了HLA測(cè)序分型技術(shù)在骨髓庫(kù)、臨床移植配型、群體遺傳學(xué)和人類(lèi)進(jìn)化研究中的大規(guī)模應(yīng)用。”深圳市組織配型與免疫遺傳醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室學(xué)科帶頭人鄧志輝博士說(shuō),進(jìn)口試劑主要針對(duì)歐美人群設(shè)計(jì),使用國(guó)外商品化HLA測(cè)序分型試劑盒檢測(cè)中國(guó)人群樣本時(shí),有時(shí)會(huì)產(chǎn)生等位基因漏檢和丟失的現(xiàn)象,增加患者移植排斥的風(fēng)險(xiǎn)。

  基于以上原因,項(xiàng)目組成員在廣東省自然科學(xué)基金、廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目、深圳市科技計(jì)劃項(xiàng)目的資助下,開(kāi)展了“HLA全長(zhǎng)序列測(cè)定及測(cè)序分型試劑的研制和應(yīng)用”項(xiàng)目的研究。

  四年研究碩果累累

  經(jīng)過(guò)四年艱辛探索,深圳市組織配型與免疫遺傳醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科研人員取得了多項(xiàng)具有國(guó)際水平的研究成果。

  率先在國(guó)際上大量和系統(tǒng)地發(fā)現(xiàn)和鑒定了中國(guó)漢族人群中的33個(gè)HLA新等位基因,獲得了國(guó)際基因庫(kù)(GenBank)和世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會(huì)的認(rèn)可。其中,HLA-A、-B位點(diǎn)新等位基因各6個(gè),HLA-DRB1位點(diǎn)2個(gè),HLA-C位點(diǎn)19個(gè)(占世界衛(wèi)生組織公布的HLA-C等位基因總數(shù)的2.3%)。研究結(jié)果修正了美國(guó)國(guó)家骨髓庫(kù)(NMDP)將HLA-A1153、C0766、C0767、C0822判定為罕見(jiàn)型等位基因的結(jié)論,實(shí)際上這些等位基因均為中國(guó)漢族人群中的常見(jiàn)型等位基因。

  項(xiàng)目組完成了中國(guó)漢族人群110個(gè)源于不同子系的HLA-A、-B、-C等位基因全長(zhǎng)序列的測(cè)定。上述全長(zhǎng)序列均延伸了世界衛(wèi)生組織IMGT/HLA數(shù)據(jù)庫(kù)中原有的序列。其中,為國(guó)際首次報(bào)道、完善的等位基因有70個(gè),占國(guó)際上已有完整的HLA-A、B、C基因組全長(zhǎng)序列的等位基因總數(shù)的40.9%(統(tǒng)計(jì)截止2010年7月30日)。項(xiàng)目所測(cè)定的全長(zhǎng)序列源于同一種族,量多而質(zhì)高,為研究HLA全長(zhǎng)序列單核苷酸多態(tài)性、各類(lèi)DNA分型引物和探針的正確設(shè)計(jì)、表達(dá)水平、分子進(jìn)化、HLA與艾滋病病毒感染和病程進(jìn)程、惡性腫瘤等疾病的研究,提供了人類(lèi)共享遺傳資源,具有重要的醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)及商業(yè)價(jià)值。

  基于HLA全長(zhǎng)序列和多態(tài)性研究,自主創(chuàng)新研制的HLA測(cè)序分型技術(shù),涵蓋了HLA-A、-B、-C基因的全部編碼區(qū),以及HLA-DRB1和-DQB1基因的第2、第3外顯子,有助于提高測(cè)序分型結(jié)果的準(zhǔn)確性。

  建立了HLA-A、-B、-C全長(zhǎng)序列分子克隆和單倍體測(cè)序的方法,將所研制的HLA測(cè)序分型技術(shù),成功地應(yīng)用于骨髓庫(kù)、臨床組織配型和群體遺傳學(xué)研究,已在國(guó)內(nèi)多家單位以及美國(guó)國(guó)立癌癥研究所(NCI)進(jìn)行推廣應(yīng)用,并獲得高度評(píng)價(jià)。

  項(xiàng)目組已申請(qǐng)國(guó)家技術(shù)發(fā)明專(zhuān)利2項(xiàng),已正式發(fā)表研究論文41篇,其中國(guó)外SCI收錄論文22篇,國(guó)家核心期刊論文19篇。

  HLA測(cè)序分型試劑有望國(guó)產(chǎn)化

  項(xiàng)目組研制的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1五個(gè)經(jīng)典基因座的測(cè)序分型,可在同一聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增條件下進(jìn)行同步擴(kuò)增,簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)操作;采用磁珠法進(jìn)行PCR產(chǎn)物和測(cè)序反應(yīng)產(chǎn)物的純化,進(jìn)一步提高了序列質(zhì)量,并適合于高通量化。

  由項(xiàng)目組研制的HLA測(cè)序分型試劑成本僅為國(guó)外進(jìn)口的同類(lèi)商品化試劑價(jià)格的1/5至1/8。也就是說(shuō),利用項(xiàng)目組研制和開(kāi)發(fā)的HLA測(cè)序分型技術(shù)將測(cè)序分型試劑國(guó)產(chǎn)化,試劑的成本將下降80%,有助于改變我國(guó)對(duì)進(jìn)口試劑的依賴(lài),產(chǎn)生良好的經(jīng)濟(jì)效益。便于HLA測(cè)序分型技術(shù)在骨髓庫(kù)、臨床移植配型、人類(lèi)學(xué)、法醫(yī)學(xué)、群體遺傳學(xué)等研究中的大規(guī)模應(yīng)用。

  鑒定委員會(huì)老師們認(rèn)為,項(xiàng)目組研制的HLA測(cè)序分型技術(shù)具有高效、低成本、適合于高通量化等特點(diǎn),為實(shí)現(xiàn)HLA測(cè)序分型試劑的國(guó)產(chǎn)化奠定了基礎(chǔ);并建議項(xiàng)目組與國(guó)內(nèi)有實(shí)力的廠(chǎng)家合作,實(shí)現(xiàn)產(chǎn)、學(xué)、研相給合,進(jìn)行HLA測(cè)序分型試劑產(chǎn)業(yè)化。

  名詞解釋

  什么是HLA?

  人類(lèi)白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,簡(jiǎn)稱(chēng)HLA)復(fù)合體,位于6號(hào)染色體短臂上,由360萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)組成,是目前已知的人類(lèi)染色體中基因密度最高,也是多態(tài)性最為豐富的區(qū)域。HLA包括一系列緊密連鎖的基因座,是人類(lèi)的主要組織相容性復(fù)合體(MHC),與人類(lèi)的免疫系統(tǒng)功能密切相關(guān)。

 

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