蛋白質(zhì)的分子組成-2018臨床助理醫(yī)師生物化學(xué)考點(diǎn)輔導(dǎo)
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一、蛋白質(zhì)的元素組成
經(jīng)元素分析,主要有 C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白質(zhì)還含微量的P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I等。
各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。因此,可以用定氮法來(lái)推算樣品中蛋白質(zhì)的大致含量。
每克樣品含氮克數(shù)×6.25×100=100g樣品中蛋白質(zhì)含量(g%)
二、蛋白質(zhì)的基本組成單位——氨基酸
蛋白質(zhì)在酸、堿或蛋白酶的作用下,最終水解為游離氨基酸(amino acid),即蛋白質(zhì)組成單體或構(gòu)件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余種,但合成蛋白質(zhì)的氨基酸僅20種(稱編碼氨基酸),最先發(fā)現(xiàn)的是天門(mén)冬氨酸(1806年),最后鑒定的是蘇氨酸(1938年)。
(一)氨基酸的結(jié)構(gòu)通式
組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸有共同的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):
1.氨基連接在α- C上,屬于α-氨基酸(脯氨酸為α-亞氨基酸)。
2.R是側(cè)鏈,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型兩種立體異構(gòu)體。天然蛋白質(zhì)中的氨基酸都是L-型。
注意:構(gòu)型是指分子中各原子的特定空間排布,其變化要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。旋光性是異構(gòu)體的光學(xué)活性,是使偏振光平面向左或向右旋轉(zhuǎn)的性質(zhì),(-)表示左旋,(+)表示右旋。構(gòu)型與旋光性沒(méi)有直接對(duì)應(yīng)關(guān)系。
(二)氨基酸的分類(lèi)
1.按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分為脂肪族、芳香族、雜環(huán)、雜環(huán)亞氨基酸四類(lèi)。
2.按R基的極性和在中性溶液的解離狀態(tài)分為非極性氨基酸、極性不帶電荷、極性帶負(fù)電荷或帶正電荷的四類(lèi)。
帶有非極性R(烴基、甲硫基、吲哚環(huán)等,共9種):甘(Gly)、丙(Ala)、纈(Val)、亮(Leu)、異亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp)
帶有不可解離的極性R(羥基、巰基、酰胺基等,共6種):絲(Ser)、蘇(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)
帶有可解離的極性R基(共5種):天(Asp)、谷(Glu)、賴(Lys)、精(Arg)、組(His),前兩個(gè)為酸性氨基酸,后三個(gè)是堿性氨基酸。
蛋白質(zhì)分子中的胱氨酸是兩個(gè)半胱氨酸脫氫后以二硫鍵結(jié)合而成,膠原蛋白中的羥脯氨酸、羥賴氨酸,凝血酶原中的羧基谷氨酸是蛋白質(zhì)加工修飾而成。
(三)氨基酸的重要理化性質(zhì)
1.一般物理性質(zhì)
α-氨基酸為無(wú)色晶體,熔點(diǎn)一般在200 oC以上。各種氨基酸在水中的溶解度差別很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀堿,但不能溶解于有機(jī)溶劑,通常酒精能把氨基酸從其溶液中沉淀析出。
芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共軛雙鍵,在近紫外區(qū)有光吸收能力,Tyr、Trp的吸收峰在280nm,Phe在265 nm。由于大多數(shù)蛋白質(zhì)含Tyr、Trp殘基,所以測(cè)定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡(jiǎn)便的方法。
2.兩性解離和等電點(diǎn)(isoelectric point, pI)
氨基酸在水溶液或晶體狀態(tài)時(shí)以兩性離子的形式存在,既可作為酸(質(zhì)子供體),又可作為堿(質(zhì)子受體)起作用,是兩性電解質(zhì),其解離度與溶液的pH有關(guān)。
在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)和程度相等,成為兼性離子,呈電中性,此時(shí)溶液的pH稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。氨基酸的pI是由α-羧基和α-氨基的解離常數(shù)的負(fù)對(duì)數(shù)pK1和pK2決定的。計(jì)算公式為:pI=1/2(pK1+ pK2)。
若1個(gè)氨基酸有3個(gè)可解離基團(tuán),寫(xiě)出它們電離式后取兼性離子兩邊的pK值的平均值,即為此氨基酸的等電點(diǎn)(酸性氨基酸的等電點(diǎn)取兩羧基的pK值的平均值,堿性氨基酸的等電點(diǎn)取兩氨基的pK值的平均值)。
3.氨基酸的化學(xué)反應(yīng)
氨基酸的化學(xué)反應(yīng)是其基團(tuán)的特征性反應(yīng)。重要的有:
(1)茚三酮反應(yīng)
所有具有自由α-氨基的氨基酸與過(guò)量茚三酮共熱形成藍(lán)紫色化合物(脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色物質(zhì))。用分光光度法可定量測(cè)定微量的氨基酸。藍(lán)紫色化合物的最大吸收峰在570nm波長(zhǎng)處,黃色在440nm波長(zhǎng)下測(cè)定。吸收峰值的大小與氨基酸釋放的氨量成正比。
(2)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)
在弱堿性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易與DNFB作用生成穩(wěn)定的黃色2,4-二硝基苯氨基酸(DNP-氨基酸),這一反應(yīng)在蛋白質(zhì)化學(xué)的研究史上起過(guò)重要作用,Sanger等人應(yīng)用它測(cè)定胰島素一級(jí)結(jié)構(gòu)。
多肽順序自動(dòng)分析儀是根據(jù)相類(lèi)似的原理設(shè)計(jì)的,即利用多肽鏈N端氨基酸的α-氨基與異硫氰酸苯酯PITC反應(yīng)(Edman降解法)。
三、肽(peptide)
1.肽鍵與肽鏈
一個(gè)氨基酸的α-羧基和另一個(gè)氨基酸的α-氨基脫水形成的酰胺鍵稱為肽鍵。由氨基酸通過(guò)肽鍵相連而成的化合物稱為肽。肽鍵及其兩端的α-碳原子相連所形成的長(zhǎng)鏈骨架,即…Cα—C—N—Cα—C—N—Cα—C—N—Cα…稱為多肽主鏈,—CαCN—是重復(fù)單位。肽鍵是蛋白質(zhì)分子中的主要共價(jià)鍵。多肽鏈的方向性是從N末端指向C末端。
肽分子中不完整的氨基酸稱為氨基酸殘基。肽按其序列從N端到C端命名。一般10肽以下屬寡肽,10肽以上為多肽。
2.生物活性肽
(1)谷胱甘肽(glutathione,GSH)
是由Glu、Cys、Gly組成的一種三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸(含γ-肽鍵)。Cys的-SH是主要功能基團(tuán),GSH是一種抗氧化劑,是某些酶的輔酶,可保護(hù)蛋白質(zhì)分子中的-SH免遭氧化,保護(hù)巰基蛋白和酶的活性。在GSH過(guò)氧化物酶的作用下,GSH還原細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生的H2O2,生成H2O,2分子GSH被氧化成GSSG,后者在GSH還原酶催化下,又生成GSH。
(2)多肽類(lèi)激素和神經(jīng)肽
人體內(nèi)有許多激素屬寡肽或多肽,如下丘腦—垂體分泌的催產(chǎn)素(9肽)、加壓素(9肽)、促腎上腺皮質(zhì)激素(ACTH,39肽)等。催產(chǎn)素和加壓素結(jié)構(gòu)僅第3、第8位兩個(gè)氨基酸殘基不同,前者使平滑肌收縮,有催產(chǎn)和使乳腺泌乳的作用;后者能使小動(dòng)脈收縮,增高血壓,也有減少排尿的作用。
神經(jīng)肽是在神經(jīng)傳導(dǎo)過(guò)程中起信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)作用的肽類(lèi)。如腦啡肽(5肽)、β-內(nèi)啡肽(31肽)、強(qiáng)啡肽(17肽)等。隨著腦科學(xué)的發(fā)展,會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的生物活性肽。
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